इस कार्यालय की उत्पत्ति 1986 में सदस्य, लेखापरीक्षा बोर्ड और पदेन निदेशक, वाणिज्यिक लेखापरीक्षा- I, नई दिल्ली के कार्यालय के निर्माण से हुई थी, जिसे फरवरी 1990 से कार्यालय प्रधान निदेशक वाणिज्यिक लेखापरीक्षा एवं पदेन सदस्य, लेखापरीक्षा बोर्ड- I, नई दिल्ली के रूप में नामित किया गया । मार्च 2020 में भारतीय लेखापरीक्षा एवं लेखा विभाग के पुनर्गठन के परिणामस्वरूप, कार्यालय का नाम बदलकर प्रधान निदेशक लेखापरीक्षा (इन्फ्रास्ट्रक्चर), दिल्ली का कार्यालय कर दिया गया।
महानिदेशक लेखापरीक्षा (इन्फ्रास्ट्रक्चर), नई दिल्ली का कार्यालय आवास और शहरी मामलों के मंत्रालय, नागरिक उड्डयन मंत्रालय, सड़क परिवहन और राजमार्ग मंत्रालय और केंद्रीय लोक क्षेत्र के उद्यम (सीपीएसई), केंद्रीय स्वायत्त की लेखापरीक्षा के लिए उत्तरदायी है। इन तीन मंत्रालयों के प्रशासनिक नियंत्रण में निकाय (सीएबी) और वैधानिक निगम हैं । इस कार्यालय के प्रमुख लेखा परीक्षितियों में, एनबीसीसी लिमिटेड, हुडको, डीएमआरसी, एनएचआईडीसीएल आदि, सीपीएसई, भारतीय राष्ट्रीय राजमार्ग प्राधिकरण (एनएचएआई), भारतीय विमानपत्तन प्राधिकरण (एएआई) और भारतीय अंतर्देशीय जलमार्ग प्राधिकरण जैसे सांविधिक निगम; डीडीए, आईआरसी, एनसीआरपीबी, डीयूएसी, बीएमटीपीसी आदि केन्द्रीय स्वायत्त निकाय, और सीपीडब्ल्यूडी जो आवास और शहरी मामलों के मंत्रालय से जुड़ा हुआ है, शामिल हैं ।
यह कार्यालय दक्षिणी, पश्चिमी और पूर्वी क्षेत्रों में स्थित लेखापरीक्षा इकाइयों के लिए निम्नलिखित उप लेखापरीक्षकों के साथ इंफ्रास्ट्रक्चर क्षेत्र की लेखापरीक्षा के लिए प्रधान लेखापरीक्षक है:
1. कार्यालय प्रधान वाणिज्यिक लेखापरीक्षा, चेन्नई
2. कार्यालय प्रधान निदेशक लेखापरीक्षा (शिपिंग), मुंबई
3. कार्यालय प्रधान निदेशक लेखापरीक्षा, हैदराबाद
4. कार्यालय प्रधान निदेशक लेखापरीक्षा (खान), कोलकाता
5. कार्यालय महानिदेशक लेखापरीक्षा (इस्पात), रांची
यह कार्यालय दिल्ली में स्थित बंदरगाह, नौवहन और जलमार्ग मंत्रालय के अधीन नामत: भारतीय अंतर्देशीय जलमार्ग प्राधिकरण (आईडब्ल्यूएआई) एक सांविधिक निगम की लेखापरीक्षा के लिए प्रधान निदेशक, लेखापरीक्षा (शिपिंग), मुंबई तथा इस्पात मंत्रालय के अधीन एक सीपीएसई नामतः जम्मू-कश्मीर खनिज विकास निगम लिमिटेड की लेखापरीक्षा के लिए महानिदेशक वाणिज्यिक लेखापरीक्षा, हैदराबाद के कार्यालय के साथ संयुक्त लेखापरीक्षक भी है ।
कार्यालय का नेतृत्व महानिदेशक लेखापरीक्षा (इन्फ्रास्ट्रक्चर) द्वारा किया जाता है । इसमें समूह अधिकारियों के पांच स्वीकृत पद इस प्रकार हैं:
1) निदेशक (प्रशासन और आईटी)
2) निदेशक (इन्फ्रास्ट्रक्चर - I)
3) निदेशक (इन्फ्रास्ट्रक्चर- II)
4) उप-निदेशक (विमानन)
5) उप-निदेशक (सड़क, परिवहन और राजमार्ग)
इस कार्यालय में दिल्ली में दो निवासी लेखापरीक्षा दल (आरएपी) भी हैं:
1. निवासी लेखापरीक्षा दल (एनएचएआई), द्वारका, नई दिल्ली ।
2. निवासी लेखापरीक्षा दल (एएआई), जोर बाग, नई दिल्ली ।
महानिदेशक लेखापरीक्षा (इन्फ्रास्ट्रक्चर) का कार्यालय, महानिदेशक लेखापरीक्षा (इन्फ्रास्ट्रक्चर), दिल्ली, महानिदेशक लेखापरीक्षा (ऊर्जा), नई दिल्ली और महानिदेशक (रेलवे वाणिज्यिक) नई दिल्ली के कार्यालयों के समूह “बी” (अराजपत्रित) और समूह "सी” कर्मचारियों की संयुक्त कार्मिक क्षमता (कंबाइंड स्ट्रेंथ) पर पर्यवेक्षक स्तर तक के सभी वाणिज्यिक संवर्ग के लिए संवर्ग नियंत्रण प्राधिकरण है ।