प्रधान महालेखाकार (लेखापरीक्षा-II), उत्तर प्रदेश का मुख्य कार्यालय ऑडिट भवन टीसी-35-वी-1, विभूति खण्ड,गोमती नगर,लखनऊ-२२६०१० में स्थित है। प्रधान महालेखाकार (लेखापरीक्षा-II), उत्तर प्रदेश को, चार समूहों के अंतर्गत उत्तर प्रदेश सरकार के विभिन्न विभागों की लेखापरीक्षा का कार्य सौंपा गया है। (1. वित्त 2. उर्जा और बिजली एवं आई.टी. और संचार 3. उद्योग और वाणिज्य, परिवहन, संस्कृति और पर्यटन 4. पर्यावरण, विज्ञान और प्रौद्योगिकी और लोक निर्माण)। इन समूहों को चार लेखापरीक्षा प्रबन्धन वर्गों में विभाजित किया गया है यथा: एएमजी-I, एएमजी-II, एएमजी-III एवं एएमजी-IV। जहाँ एएमजी-II, एएमजी-III, एएमजी-IV मुख्य कार्यालय लखनऊ में स्थित है वही एएमजी-I, शाखा कार्यालय प्रयागराज में स्थित है। प्रत्येक एएमजी का नेतृत्व वर्गाधिकारी द्वारा किया जाता है। प्रधान महालेखाकार (लेखापरीक्षा-II) का शाखा कार्यालय सत्यनिष्ठा भवन,15-ए दयानन्द मार्ग, प्रयागराज – २११००१ में स्थित है।
प्रधान महालेखाकार (लेखापरीक्षा-II), उत्तर प्रदेश को राज्य वित्त, आर्थिक क्षेत्र एवं राजस्व क्षेत्र पर लेखापरीक्षा प्रतिवेदनो एवं इसके अतिरिक्त, निष्पादन लेखापरीक्षा के सबंध में इस कार्यालय के क्षेत्राधिकार में आने वाले विभागों/सार्वजनिक क्षेत्र निकायों/ दूसरे संस्थाओ के प्रतिवेदन को तैयार करने का सौंपा गया है।
प्रधान महालेखाकार (लेखापरीक्षा-II) लेखापरीक्षा प्रतिवेदनों की चर्चा में लोक लेखा समिति (PAC) और सार्वजनिक उपक्रम समिति (COPU) की सहायता करते है।