क्षेत्रीय प्रशिक्षण संस्थान का नेतृत्व प्रधान निदेशक करता है जो भा. ले. तथा ले. वि. में विभागाध्यक्ष के रूप में नामित होता है। क्षेत्रीय प्रशिक्षण संस्थान, शिलांग का संगठनात्मक चार्ट निम्नानुसार है: -
  1. प्रधान निदेशक

  25      स्वीकृत शक्ति
  11      स्थिति में व्यक्ति

*   2 ड्राइवरों आउटसोर्स एजेंसी से लगे हुए हैं |
**  7 एम.टी.एस. आउटसोर्स एजेंसी से लगे हुए है |
#  4 किचन स्टाफ और 8 हाउसकीपिंग स्टाफ आउटसोर्स एजेंसी से लगे हुए हैं |