इस कार्यालय को 1 अप्रैल 1986 को प्रधान निदेशक लेखापरीक्षा, वैज्ञानिक विभागों के कार्यालय के रूप में स्थापित किया गया था। मई 2018 में, इस कार्यालय को महानिदेशक, लेखापरीक्षा, वैज्ञानिक विभागों के कार्यालय के रूप में पुनः नामित किया गया था। यह कार्यालय वैज्ञानिक और पर्यावरण मंत्रालयों/विभागों की लेखापरीक्षा के लिए उत्तरदायी है, जिसमें उनके संबद्ध और अधीनस्थ कार्यालयों के साथ-साथ संपूर्ण भारत में स्थित स्वायत्त निकाय शामिल हैं। कार्यालय को पर्यावरण लेखापरीक्षा के लिए नोडल कार्यालय के रूप में भी नामित किया गया है।

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