महालेखाकार का कार्यालय, गोवा भारतीय लेखापरीक्षा और लेखा विभाग का एक क्षेत्रीय कार्यालय है, जो भारत के नियंत्रक-महालेखापरीक्षक के अधीन है। भारत के नियंत्रक-महालेखापरीक्षक भारत के राष्ट्रपति द्वारा नियुक्त एक संवैधानिक प्राधिकारी है। भारत के नियंत्रक-महालेखापरीक्षक के कार्यों का अधिदेश मुख्य रूप से भारत के संविधान के अनुछेद 149 और 151 के प्रावधानों से प्राप्त होता है। भारत के नियंत्रक-महालेखापरीक्षक के कर्तव्य, शक्तियाँ और सेवा की शर्ते (डी.पी.सी) अधिनियम संविधान के अनुछेद 148(3) और 149 के तहत वर्ष 1971 मे संसद द्वारा पारित किया गया था। इस कार्यकाल का उन्नयन 1 जनवरी 2004 को वरिष्ठ उप महालेखाकर का कार्यालय (लेखापरीक्षा), गोवा से किया गया था।