कोषाध्यक्ष / सीपीएओ, सिक्किम के प्रशासनिक नियंत्रण में कार्य करते हैं। निम्नलिखित अधिकारियों की अध्यक्षता में छह खाते प्रदान करने वाली इकाइयाँ हैं, जो सिविल, सार्वजनिक कार्यों और वन प्रभागों से संबंधित प्रारंभिक खातों को वरिष्ठ उप महालेखाकार (लेखा और ) का कार्यालय सिक्किम, गंगटोक।

• सचिव, वेतन और लेखा अधिकारी, राज्य विधान सभा
• ट्रेजरी / पीएओ, मुख्यालय, सिक्किम, गंगटोक के निदेशक।
• अपर निदेशक, मुख्य वेतन और लेखा कार्यालय, पूर्वी सिक्किम, गंगटोक।
• मुख्य वेतन और लेखा अधिकारी, Gyalsing, पश्चिम सिक्किम।
• मुख्य वेतन और लेखा अधिकारी, मंगन, उत्तरी सिक्किम।
• मुख्य वेतन और लेखा कार्यालय, नामची, दक्षिण सिक्किम

ट्रेजरी के निदेशक के नियंत्रण में चार जिला, मुख्य वेतन और लेखा कार्यालय हैं। पूर्व, पश्चिम, उत्तर और दक्षिण और एक वेतन और लेखा कार्यालय, मुख्यालय । मुख्य वेतन और लेखा कार्यालयों में से प्रत्येक गैर बैंकिंग कोषागार के रूप में कार्य करता है। जिला मुख्य वेतन और लेखा कार्यालय और मुख्य वेतन और लेखा कार्यालय, Hqr। ट्रेजरी के प्रिंसिपल डायरेक्टर के कार्यालय में बुनियादी इकाइयाँ हैं, जिनके माध्यम से राज्य के भुगतान के सभी प्रकार के प्राधिकरण किए जाते हैं। मुख्य वेतन और लेखा कार्यालय और वेतन और लेखा कार्यालय, सिक्किम विधान सभा सचिवालय, सरकार के खातों को बनाए रखने और सिक्किम का स्टेट बैंक से प्राप्त उपकरणों के संदर्भ में वरिष्ठ उप महालेखाकार कार्यालय (लेखा और प्रवेश) के कार्यालय में जमा करें। अन्य राज्यों के विपरीत, भारतीय रिज़र्व बैंक का आज तक सरकारी कारोबार में इस राज्य में संचालन नहीं है क्योंकि भारतीय रिज़र्व बैंक और सिक्किम के बीच भारतीय रिज़र्व बैंक अधिनियम, 1934 की धारा 21 ए के संदर्भ में कोई समझौता नहीं है। सिक्किम सरकारी बैंकर के रूप में कार्य करता है और राज्य भर में अपनी शाखाओं के माध्यम से सरकार की प्राप्तियों (सरकार के स्वयं के राजस्व) को प्राप्त करता है। सिक्किम राज्य के साथ सभी अंतर सरकारी लेनदेन सिविल खातों के मैनुअल के पैरा 8.20 के प्रावधान के अनुसार चेक / बैंक ड्राफ्ट के माध्यम से तय किए जाते हैं।

उपरोक्त के अतिरिक्त, पेंशन निदेशालय, सामान्य भविष्य निधि और समूह बीमा योजना को समूह बीमा योजना, सामान्य भविष्य निधि, पेंशन और राज्य सरकार के कर्मचारियों के सीपीएफ / एनपीएस के रखरखाव की जिम्मेदारी दी गई है जिसमें सामान्य भविष्य निधि न्यायाधीश शामिल हैं। उच्च न्यायालय। पेंशन निदेशालय केंद्रीय पेंशन (नागरिक और रक्षा) और अन्य राज्य सरकारों के पेंशनभोगियों से संबंधित पेंशन का भुगतान भी करता है, जो सिक्किम में रहते हैं और सिक्किम के खजाने से अपनी पेंशन खींचने का विकल्प चुनते हैं। सामान्य भविष्य निधि और पेंशन के कार्यों को वित्त विभाग, सिक्किम सरकार द्वारा निर्धारित सामान्य भविष्य निधि और पेंशन नियमों द्वारा विनियमित किया जाता है।

कार्यालय के वरिष्ठ उप महालेखाकार (लेखा और प्रवेश), सिक्किम सरकार के केवल मासिक सिविल खातों और वार्षिक वित्त और विनियोग खातों को तैयार करता है, यंत्रों के संकलन के बाद। वाउचर, चैलेंज / बैंक प्राप्तियां और विभिन्न मुख्य वेतन और लेखा कार्यालयों से प्राप्त कार्यों / वन प्रभागों से संबंधित संकलित खाते। अन्य राज्यों में महालेखाकार के कार्यालयों के विपरीत, इस कार्यालय द्वारा पात्रता पर कोई अन्य कार्य नहीं किया जाता है। इस प्रणाली को इस राज्य में पेश किया गया था।